ภารกิจพื้นฐานของกองทัพเรือชิลีคือการมีส่วนร่วมในการรักษาความปลอดภัยต่างประเทศและการป้องกันทางทหารของประเทศ ในการปกป้องอธิปไตยและบูรณภาพแห่งดินแดน ในยามสงบจะส่งเสริมผลประโยชน์ของชาติในต่างประเทศและส่งเสริมการพัฒนาประเทศ
กองทัพเรือเป็นสถาบันฝึกอบรมสำหรับมืออาชีพ สร้างสรรค์เทคโนโลยีและยุทธวิธีที่ทันสมัย ยืดหยุ่นต่อการเปลี่ยนแปลงและความท้าทาย และแข็งแกร่งทั้งในแง่ของหลักการและค่านิยม ซึ่งพัฒนาและเตรียมใช้ทรัพยากรเพื่อประโยชน์สูงสุดของชาวชิลีทุกคน .